Se você estiver vinculando aos conectores MySQL em seu aplicativo, sim - seu aplicativo é considerado "trabalho baseado nesse programa" de acordo com a GPL. Você tem 2 opções:

1. 
   Licencie seu aplicativo sob uma licença compatível com GPL.
   
2. 
   Torne-se um MySQL Ready Partner (gratuito) e tenha um de seus aplicativos aprovados pelo MySQL. Isso concede a você acesso aos Conectores sob uma licença dupla - que permitirá que você use os Conectores com código proprietário. Mais informações aqui:https://partner-portal.mysql.com/guide/overview .html
   

(Observe que os Conectores concedem exceções ao licenciamento GPL para projetos de código aberto.)