OK, esta pergunta deve ser fechada como não relacionada à programação, esta é realmente uma pergunta para o próximo site "irmã", mas vou tentar respondê-la de qualquer maneira. Agora eu nunca usei o MySQL e alguém provavelmente pode fazer uma resposta melhor.
Vamos começar com um pesquisa no google
(5 minutos depois ... decidi mergulhar depois de apenas ler alguns resultados)
- baixar + instalar o pacote mysql essencial (mysql-essential-5.1.30-win32.msi)
- executar assistente de configuração
- execute o assistente de configuração novamente (modificando o caminho do banco de dados, número da porta)
- dê uma olhada em http:// dev.mysql.com/doc/refman/5.1/en/multiple-windows-services.html
- dê uma olhada no my.ini (e no backup)
- descobri que preciso fazer uma cópia do diretório de dados e mesclar ini com o arquivo ini de backup e não precisei executar o assistente de configuração duas vezes. Deveria ter apenas editado o INI para começar (mas isso exigiria a leitura do manual... muito trabalho! O arquivo ini está bem documentado de qualquer maneira)
- mesclar arquivos ini, fazer modificações no nome do serviço
- executar comandos:mysqld --install mysql1, mysqld --install mysql2, net start mysql1, net start mysql2
20 minutos, pronto.
Agora temos instruções passo a passo para executar várias instâncias do MySQL em uma única máquina, que provavelmente aparecerá como o primeiro resultado no google na próxima vez que alguém pesquisar por ele;)