Para você fazer isso acontecer - eu acredito - você tem que usar AJAX.
O código ficará assim:
$.ajax({
url: 'your_script.php',
type: 'POST',
data: {var1: javascript_var_1, var2: javascript_var_2},
success: function(data) {
console.log("success");
}
});
Seu PHP será semelhante a este (sem ter em mente a codificação JSON:
<?php
$var1 = $_POST['var1'];
$var2 = $_POST['var2'];
$getvalue="SELECT id,name from table1 WHERE column1='$var1' and column2='$var2'";
$result=mysql_query($getvalue) or die(mysql_error());
while($row=mysql_fetch_array($result)){
extract($row);
echo $name;
}
?>
Então você pode codificar JSON os resultados e praticamente produzi-los no sucesso. Seu script php - no entanto - deve estar em outro arquivo php.
Além disso, escape seus dados. Use declarações preparadas.