Para muitas operações (especialmente CRUD, que funcionam imediatamente depois que você escreve os arquivos de esquema), o ORM Framework Doutrina é realmente ótimo.

Se você quiser ir além do acesso ao banco de dados, você pode dar uma olhada no PHP FRAmework symfony , que fornece um gerador de administração (há até um screencast sobre isso ).(E tem uma ótima documentação, como o tutorial do jobeet )(BTW, o symfony usa o Doctrine como ORM ^^ )

Mas talvez seja um pouco exagerado (e requer uma curva de aprendizado muito grande) se você precisar de algo simples ...

Para carregar dados no MySQL, que tal LOAD DATA INFILE , que (citação dos documentos) "lê linhas de um arquivo de texto em uma tabela em uma velocidade muito alta".