Isso pode ser possível se você mencionar a seguinte propriedade na url
spring.datasource.url=jdbc:mysql://localhost:3306/test?allowMultiQueries=true
O allowMultiQueries instruirá o driver a enviar consultas delimitadas ao banco de dados.
Observe que, se você estiver usando consultas nativas, esteja ciente do ataque de injeção de sql. Você não precisa colocar o delimitador (DELIMITER) explicitamente. A instrução sqlA consulta a seguir funciona
SET myDatabase;
DROP PROCEDURE IF EXISTS myStoredProcedure;
CREATE PROCEDURE myStoredProcedure ( _description VARCHAR(50), _value INT )
BEGIN
INSERT INTO
myTable ( description, value )
VALUES ( _description, _value );
SELECT id, description, value
FROM myTable
WHERE id = LAST_INSERT_ID();
END;