Uau. Resistir. Antes de fazer qualquer outra coisa, pare e ative sua máquina mysql fora do beanstalk ou use Amazon RDS . O Beanstalk foi projetado para dimensionar automaticamente a camada da Web do seu aplicativo, não para armazenar seu banco de dados. No momento em que dimensionar seu aplicativo, essa nova máquina não terá seus dados. No momento em que reduzir, poderá remover sua máquina de banco de dados. Se essa instância acabar em um hardware aposentado ou corrompido, o beanstalk a substituirá.

Leia a visão geral da arquitetura do Beanstalk. Observe o diagrama. Sua camada de banco de dados existe fora do ambiente beanstalk, não nele.