Se você quiser usar soquetes UNIX com o Mysql JDBC Connector/J, você precisa fornecer um socketFactory .
Portanto, isso varia de acordo com a implementação que você usa. Por padrão, o Mysql não vem com nenhuma implementação para isso, apenas fornece um exemplo para tal fábrica em seu código-fonte.
Existe uma biblioteca Java de soquete UNIX chamada junixsocket que também tem um socketFactory implementação de classe. Um exemplo é descrito em Conectando-se a um banco de dados MySQL via Unix Domain Sockets que faz parte de sua documentação.
Você pode encontrar mais alternativas de biblioteca de soquete Java UNIX no material de perguntas e respostas relacionado: