Este me ajudou:
Abra o shell no painel de controle e inicie o mysql com este comando:
mysqld –-console –-skip-grant-tables –-skip-external-locking
Abra outro shell no painel de controle e repare o banco de dados com este comando:
mysqlcheck -r --databases mysql --use-frm
Pare o mysql, feche os shells e reinicie o mysql normalmente.
baseado em:Re:mysql.users corrompido como corrigir