Existe uma maneira, veja este link:http ://blog.nth-design.com/2009/02/25/creating-sp-in-phpmyadmin/
Citar a partir desse link
1.Abra o phpMyadmin.
2.Selecione um banco de dados para trabalhar.
3.Abra a aba SQL.
4.Selecione todas as instruções SQL entre as instruções DELIMITER em seu script de procedimento armazenado. Não inclua as declarações DELIMITER! Aqui está como meu script de exemplo deve se parecer:
DROP PROCEDURE IF EXISTS spFoo $$
CREATE PROCEDURE spFoo ()
BEGIN
SELECT 'Foo' FROM DUAL;
END $$
5.No campo delimitador, logo abaixo da área de texto do editor SQL , insira $$ como seu delimitador.