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Remover duplicatas usando apenas uma consulta MySQL?


Considere o seguinte caso de teste:
CREATE TABLE mytb (url_id int, url_addr varchar(100));

INSERT INTO mytb VALUES (1, 'www.google.com');
INSERT INTO mytb VALUES (2, 'www.microsoft.com');
INSERT INTO mytb VALUES (3, 'www.apple.com');
INSERT INTO mytb VALUES (4, 'www.google.com');
INSERT INTO mytb VALUES (5, 'www.cnn.com');
INSERT INTO mytb VALUES (6, 'www.apple.com');

Onde nossa tabela de teste agora contém:
SELECT * FROM mytb;
+--------+-------------------+
| url_id | url_addr          |
+--------+-------------------+
|      1 | www.google.com    |
|      2 | www.microsoft.com |
|      3 | www.apple.com     |
|      4 | www.google.com    |
|      5 | www.cnn.com       |
|      6 | www.apple.com     |
+--------+-------------------+
5 rows in set (0.00 sec)

Então podemos usar a tabela múltipla DELETE sintaxe da seguinte forma:
DELETE t2
FROM   mytb t1
JOIN   mytb t2 ON (t2.url_addr = t1.url_addr AND t2.url_id > t1.url_id);

... que excluirá entradas duplicadas, deixando apenas o primeiro URL baseado em url_id :
SELECT * FROM mytb;
+--------+-------------------+
| url_id | url_addr          |
+--------+-------------------+
|      1 | www.google.com    |
|      2 | www.microsoft.com |
|      3 | www.apple.com     |
|      5 | www.cnn.com       |
+--------+-------------------+
3 rows in set (0.00 sec)

ATUALIZAÇÃO - Além dos novos comentários acima:

Se os URLs duplicados não tiverem o mesmo formato, você pode aplicar o REPLACE() função para remover www. ou http:// partes. Por exemplo:
DELETE t2
FROM   mytb t1
JOIN   mytb t2 ON (REPLACE(t2.url_addr, 'www.', '') = 
                   REPLACE(t1.url_addr, 'www.', '') AND 
                   t2.url_id > t1.url_id);