Você pode usar o MySQL Workbench que fornece uma maneira de migrar rapidamente dados e aplicativos do Microsoft SQL Server para o MySQL, empregando menos tempo e esforço.

Esta ferramenta tem muitos recursos interessantes como:

• Migrações de banco de dados - permite migrações do Microsoft SQL Server, Sybase ASE e PostgreSQL.
• Gerenciamento de projetos de migração - permite que as migrações sejam configuradas, copiadas, editadas, executadas e agendadas.

Leia maishttp://www.mysql.com/products/workbench/migrate/