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Como configurar a estrutura de índice do ElasticSearch com várias associações de entidade


Isso é um grande começo!

Eu definitivamente achataria tudo (ou seja, desnormalizar ) e crie documentos do produto que se pareçam com o abaixo. Dessa forma, você se livra do relacionamento N:M entre produtos e sinalizadores simplesmente criando um flags matriz para cada produto. Assim, será mais fácil consultar esses sinalizadores.
{
   "id": "00c8234d71c4e94f725cd432ebc04",
   "title": "Alpha",
   "price": 589.0,
   "flags": ["Sellout", "Top Product"]
}
{
   "id": "018357657529fef056cf396626812",
   "title": "Beta",
   "price": 355.0,
   "flags": ["Discount"]
}
{
   "id": "01a2c32ceeff0fc6b7dd4fc4302ab",
   "title": "Gamma",
   "price": 0.0,
   "flags": ["Discount"]
}

O tipo de mapeamento do produto ficaria assim:
PUT products
{
    "mappings": {
        "product": {
            "properties": {
                "id": {
                    "type": "string",
                    "index": "not_analyzed"
                },
                "title": {
                    "type": "string"
                },
                "price": {
                    "type": "double",
                    "null_value": 0.0
                },
                "flags": {
                    "type": "string",
                    "index": "not_analyzed"
                }
            }
        }
    }
}

Como você tem o logstash jdbc entrada já, tudo o que está faltando é a consulta SQL adequada para buscar os produtos e sinalizadores associados.
  SELECT p.Id as id, p.Title as title, p.Price as price, GROUP_CONCAT(f.Title) as flags
    FROM Products p
    JOIN flagsProducts fp ON fp.ProductId = p.Id
    JOIN Flags f ON fp.FlagId = f.id
GROUP BY p.Id

O que geraria linhas como estas:
+-------------------------------+-------+-------+---------------------+
| id                            | title | price | flags               |
+-------------------------------+-------+-------+---------------------+
| 00c8234d71c4e94f725cd432ebc04 | Alpha |   589 | Sellout,Top product |
| 018357657529fef056cf396626812 | Beta  |   355 | Discount            |
| 01a2c32ceeff0fc6b7dd4fc4302ab | Gamma |     0 | Discount            |
+-------------------------------+-------+-------+---------------------+

Usando os filtros do Logstash, você pode dividir os flags em uma matriz e você está pronto para ir.