Examinando os testes SqlAlchemy , descobri que
sqlalchemy.sql.expression.func.substring compila para SUBSTRING para PSQL : def test_substring(self):
self.assert_compile(
func.substring("abc", 1, 2),
"SUBSTRING(%(substring_1)s FROM %(substring_2)s "
"FOR %(substring_3)s)",
)
self.assert_compile(
func.substring("abc", 1),
"SUBSTRING(%(substring_1)s FROM %(substring_2)s)",
)
func.substring(str, from, [for]) é realmente o que você quer. É "delineado por vírgulas" porque é assim que os métodos Python Se você quiser gerar o SQL você mesmo, você pode fazer algo como
text("SUBSTRING('foo' FROM 1 FOR 2)") , mas não vejo por que você faria. 
