PostgreSQL
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sqlalchemy, filtre uma coluna json contendo uma matriz


No PostgreSQL com JSONB você pode usar a verificação de contenção:
dict = {"telephones": [{"telephone": "54435345"}]}
user = cls.query.filter(your_table.contact_info.contains(dict)).first()

No MySQL pode ser possível usar func .json_contains :

(você precisa se adaptar e experimentar, certamente o caminho do MySQL, mas provavelmente também o do PostgreSQL)