Tenho boas notícias para todos vocês. Existe um suplemento SSMS para isso. Permite organizar em pastas personalizadas todos os bancos de dados, procedimentos armazenados e outros objetos de banco de dados. Assim como se fosse uma funcionalidade nativa do SQL Server Management Studio.
O nome da ferramenta é SQL Handy Groupie e pode ser encontrado em www.skilledsoftware.com . Divirta-se.