O mySQL fará isso quando encontrar um caractere inválido no conjunto de caracteres atual.

Você não está mencionando qual ferramenta está usando para importar os dados, mas deve ser capaz de especificar um conjunto de caracteres ao importar. Se esse conjunto de caracteres corresponder ao do banco de dados, tudo ficará bem. Além disso, verifique se o arquivo está realmente codificado nesse conjunto de caracteres.

Se sua ferramenta de importação não oferece a opção de selecionar o conjunto de caracteres, você pode tentar phpMyAdmin que faz.