Você pode fazer tão simples quanto editar o arquivo de configuração do phpmyadmin sem sobrecarregar o NGINX

• 
  Abra o arquivo config.inc.phpsudo nano /etc/phpmyadmin/config.inc.php
  
• 
  Adicione o seguinte código a ele
  
  $cfg['PmaAbsoluteUri'] = $_SERVER[HTTP_HOST].dirname($_SERVER[SCRIPT_NAME]);
  
• 
  Feito
  

Créditos:xaz0r