Como se conectar ao banco de dados sqlite com senha

Esta é a string de conexão com senha

Data Source=filename;Version=3;Password=myPassword;

Como você afirmou que usa navicat para definir a criptografia sqlite. Criptografia significa que você criptografou o banco de dados, é diferente de definir uma senha para um banco de dados.

ao definir uma senha para um banco de dados, tente este código ..

//create file 
SQLite.SQLiteConnection.CreateFile("c:\\mydatabase file.db3")
Dim cn As New SQLite.SQLiteConnection
//set password
cn.ChangePassword("paxword")
//remove password
cn.ChangePassword("")

Remova a criptografia primeiro ..