Eu estava lidando com o mesmo problema.
Abri o jar e descobri que a pasta views estava enterrada e a pasta extra mais profunda do que esperávamos. Deve funcionar por tempo suficiente até que eles consertem na próxima versão.
Solução rápida que funcionou para mim:
#extract folder
jar xfv logstash-1.1.11.dev-flatjar.jar logstash/web/views
#move files around
cp -r logstash/web/views/views/ logstash/web/
rm -rf logstash/web/views/views
# push files in jar
jar uvf logstash-1.1.11.dev-flatjar.jar logstash/web/views/