adicionar condição ao resultado dos valores mais recentes

Quando uma operação envolve desativar documentos completos, pense em $group . Adicionar isso ao seu pipeline deve apontar na direção certa.

(playground)

db.collection.aggregate([
  {
    "$group": {
      _id: "cars",
      "cars": {
        "$push": {
          "$cond": [
            {
              "$ne": [
                {
                  "$arrayElemAt": [
                    "$mostRecentValues",
                    0
                  ]
                },
                {
                  "$arrayElemAt": [
                    "$mostRecentValues",
                    1
                  ]
                }
              ]
            },
            "$$ROOT",
            "$$REMOVE"
          ]
        }
      }
    }
  },
  {
    $unwind: "$cars"
  }
])

Se você tiver apenas 3 campos em cada documento, poderá adicionar:

  {
    $project: {
      car_id: "$cars.car_id",
      mostRecentTime: "$cars.mostRecentTime",
      mostRecentValues: "$cars.MostRecentValues"
    }
  }