Pode haver duas razões.

1. 
   Pode haver outros documentos na coleção com o mesmo _children.videosTags.id
   
2. 
   É bem possível que mais de um documento não tenha _children.videosTags.id" ou com valor nulo.
   

Como você está criando unique key, valores nulos ou vazios são difíceis. A solução é criar sparse index e se sua versão do MongoDB for 3.2+, crie um índice parcial. Consulte a documentação para índices parciais.