Eu descobri. Você pode fazer isso a partir do arquivo python e funcionará:
connection = pymongo.MongoClient(ab123456.mlab.com, 123456)
db = connection[databasename]
db.authenticate(database_user, database_pass)
connection = pymongo.MongoClient(ab123456.mlab.com, 123456)
db = connection[databasename]
db.authenticate(database_user, database_pass)