Na verdade, você está fechando sua conexão com o banco de dados antes que os dados da coleção retornem.
db.collection('users', function(err, collection) {
collection.find({}, function(err, cursor) {
cursor.each(function(err, item) {
console.log(item);
});
// our collection has returned, now we can close the database
db.close();
});
});
