Tentei reproduzir o que você fez. Eu matei um banco de dados usando db.dropDatabase() depois de fazer backup :-) O nome do banco de dados era 'gacheater'. Antes de soltar a pasta mongodb continha 3 arquivos (o db não está vazio):

• gacheater.ns
• gacheater.1
• gacheater.2

depois de soltar esses arquivos desapareceu. Portanto, acho que mongodb realmente remove seus dados .

Portanto, a única opção que você tem é tentar restaurar os arquivos do sistema de arquivos

PS:MacOS 10.5, MongoDB 1.8.2