Não, os índices parciais suportam apenas um subconjunto dos operadores no filtro usado. Os únicos operadores suportados são:$AND (somente no nível superior), $EQ , $LT , $LTE , $GT , $GTE , $EXISTS e o TYPE_OPERATOR .

Isso deixa de fora, por exemplo $NOT , $REGEX , $OR , etc

Você pode ver isso na fonte do MongoDB aqui .

Existem também algumas limitações gerais em índices parciais:

• _id índices não podem ser índices parciais.
• Índices esparsos não podem ser índices parciais.
• Os índices de chave de fragmentação não podem ser índices parciais.
• Os índices parciais não são compatíveis com versões anteriores à 3.2.