Mesclar documentos com suas matrizes aninhadas e suas matrizes aninhadas

Você pode usar $reduce com $concatArrays para achatar sua estrutura de dados e, em seguida, execute $unwind com $replaceRoot para obter um único membro por documento:

db.collection.aggregate([
  { "$project": {
    "members": {
      "$concatArrays": [
        [{ "userID": "$userID", "userType": "$userType" }],
        { "$reduce": {
          "input": "$clients",
          "initialValue": [],
          "in": {
            "$concatArrays": [
              "$$value",
              [{ "userID": "$$this.userID", "userType": "$$this.userType" }],
              "$$this.members"
            ]
          }
        }}
      ]
    }
  }},
  { "$unwind": "$members" },
  { "$replaceRoot": { "newRoot": "$members" }}
])

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