Se você deseja encontrar o valor máximo do código de todos os códigos de menus, a consulta provável será a seguinte:
db.menucategories.aggregate([
{ $unwind: '$menus' },
{ $group: { _id: null, max: { $max: '$menus.code' } } },
{ $project: { max: 1, _id:0 } }
])
Clique nos links abaixo para obter mais informações sobre os diferentes operadores:
$unwind , $group , $project