Se você estiver usando o MongoDB 3.2, poderá usar o índice parcial exclusivo em vez de índice esparso.
O índice parcial é realmente recomendado sobre o índice esparso
Exemplo
db.users.createIndex({ "userId": 1, "project": 1 },
{ unique: true, partialFilterExpression:{
userId: { $exists: true, $gt : { $type : 10 } } } })
db.users.createIndex({ "anonymousId": 1, "project": 1 },
{ unique: true, partialFilterExpression:{
anonymouseId: { $exists: true, $gt : { $type : 10 } } } })
No exemplo acima, o índice exclusivo só será criado quando
userId está presente e não contém valor nulo. O mesmo vale para anonymousId também. Consulte https://docs.mongodb.org/ manual/core/index-unique/#unique-partial-indexes
