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Como projetar/filtrar chaves incorporadas com a aplicação de regex na chave


Você não pode use regex na projeção. Você precisa especificar explicitamente a projection argumento para o .find() método
db.collection.find({}, 
    { 
        "data.2007.actual": 1, 
        "data.2007.upper_end_of_range": 1, 
        "data.2008.actual": 1, 
        "data.2008.upper_end_of_range": 1, 
        "table_name": 1 
    }
)