Também enfrentei problemas semelhantes com alguns shell de código baixados funcionando corretamente, mas o driver Node falhou (não havia outra biblioteca externa como o mangusto). Minha versão do MongoDB instalada era 2.6.6 e o ​​package.json tinha uma entrada mongodb como "~1.3.18". Com uma sugestão de alguém, alterei o valor da entrada para "~1.4.31", o que resolveu meu problema.