Você pode consultar todos os trabalhos em execução usando db.currentOp().
Normalmente, um trabalho de Mapear/Reduzir tem alguns atributos que você pode consultar.
Um trabalho M/R que acabei de executar tinha as seguintes estatísticas:
"opid" : 258101377,
"active" : true,
"secs_running" : 4638,
"op" : "query",
"ns" : "<database>.<collectionname>",
"query": {
"mapreduce": "<collectionname>",
"map": function <randomname>() { ... },
"reduce": function <randomname>(k, v) { ... },
"out": { ... }
}
"msg": "m/r: (1/3) emit phase 1235099/11558528 10%",
"progress" : {
"done" : 1235099,
"total" : 11558528
},
...
É isso que você deve procurar! Especialmente o atributo "msg", que diz como está o progresso do M/R.