Consulte os documentos para atualizar uma matriz. Seu código deve ser algo como:
servidor
Meteor.methods({
'content.update.lastModified': function(contentId, peerId) {
check(contentId, String);
check(peerId, String);
var selector = {_id : id, 'Peers.uniquePeer': peerId};
var modifier = {$set: {'Peers.$.lastModified': 'Now'}};
Content.update(selector, modifier);
}
})
cliente
Meteor.call('content.update.lastModified', contentId, peerId);
Observe que esse tipo de operação precisa ocorrer em um método definido pelo servidor porque, como você descobriu, você só pode atualizar documentos por id no cliente.