Desculpe, acabei de descobrir.
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Você precisa ir para "Connect" no Atlas, vá para "Connect Your Application" (NÃO "Connect with MongoDB Compass")
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Altere a versão do Node.js para "2.2.12 ou posterior"
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Copie a string de conexão normalmente, substitua a senha e cole no Compass
Edit:Eu encontrei ainda mais detalhes - o problema subjacente pode ser o seu DNS. Tente substituí-lo pelo DNS do Google, por exemplo (8.8.8.8) para ver se ele corrige o problema e continue usando a string de conexão atualizada.