Para carregar os dados iniciais, você pode usar a ferramenta de migração de banco de dados como MongoBee

É uma opção muito útil para lidar com a inicialização de dados em java. Você só precisa configurar @Bean public Mongobee mongobee em sua inicialização de primavera e verificação de componentes de configuração para dados ChangeLogs onde a criação de dados realmente acontece.