Você já está fazendo todas as coisas certas na consulta, pois precisa
$group no nível que você tem para obter as somas corretas. A única coisa que resta é juntar tudo. Pessoalmente, eu ficaria com o "par" em uma matriz como a saída final:
Machine.aggregate([
{ "$match": {
"idc": req.query.idc, "customer": req.query.customer}
} ,
{ "$group": {
"_id": {
"cluster": "$cluster",
"idc":"$idc",
"type": "$type"
},
"SumCores": { "$sum":"$cores" },
"SumMemory": { "$sum":"$memory" }
}},
{ "$group": {
"_id": {
"cluster": "$_id.cluster",
"idc": "$_id.idc"
},
"data": {
"$push": {
"type": "$_id.type",
"SumCores": "$SumCores",
"SumMemory": "$SumMemory"
}
}
}},
{ "$sort" : { "_id.idc": -1, "_id.cluster": 1 } }
]);
O que lhe daria:
{
"_id" : {
"cluster" : 1,
"idc" : "LH8"
},
"data" : [
{
"type" : "Virtual",
"SumCores" : 232,
"SumMemory" : 469
},
{
"type" : "Physical",
"SumCores" : 256,
"SumMemory" : 1024
}
]
}
{
"_id" : {
"cluster" : 1,
"idc" : "LH5"
},
"data" : [
{
"type" : "Virtual",
"SumCores" : 112,
"SumMemory" : 384
},
{
"type" : "Physical",
"SumCores" : 192,
"SumMemory" : 768
}
]
}
Mas se você realmente precisa, pode filtrar os elementos correspondentes da matriz e colocá-los em suas próprias propriedades:
Machine.aggregate([
{ "$match": {
"idc": req.query.idc, "customer": req.query.customer}
} ,
{ "$group": {
"_id": {
"cluster": "$cluster",
"idc":"$idc",
"type": "$type"
},
"SumCores": { "$sum":"$cores" },
"SumMemory": { "$sum":"$memory" }
}},
{ "$group": {
"_id": {
"cluster": "$_id.cluster",
"idc": "$_id.idc"
},
"data": {
"$push": {
"type": "$_id.type",
"SumCores": "$SumCores",
"SumMemory": "$SumMemory"
}
}
}},
{ "$project": {
"Physical": {
"$setDifference": [
{ "$map": {
"input": "$data",
"as": "el",
"in": {
"$cond": [
{ "$eq": [ "$$el.type", "Physical" ] },
{
"SumCores": "$$el.SumCores",
"SumMemory": "$$el.SumMemory"
},
false
]
}
}},
[false]
]
},
"Virtual": {
"$setDifference": [
{ "$map": {
"input": "$data",
"as": "el",
"in": {
"$cond": [
{ "$eq": [ "$$el.type", "Virtual" ] },
{
"SumCores": "$$el.SumCores",
"SumMemory": "$$el.SumMemory"
},
false
]
}
}},
[false]
]
}
}},
{ "$unwind": "$Physical" },
{ "$unwind": "$Virtual"},
{ "$sort" : { "_id.idc": -1, "_id.cluster": 1 } }
]);
O que dá seu resultado:
{
"_id" : {
"cluster" : 1,
"idc" : "LH8"
},
"Physical" : {
"SumCores" : 256,
"SumMemory" : 1024
},
"Virtual" : {
"SumCores" : 232,
"SumMemory" : 469
}
}
{
"_id" : {
"cluster" : 1,
"idc" : "LH5"
},
"Physical" : {
"SumCores" : 192,
"SumMemory" : 768
},
"Virtual" : {
"SumCores" : 112,
"SumMemory" : 384
}
}
Mas o primeiro só vai fornecer os mesmos dados essenciais sem precisar de uma passagem extra pelos resultados.
De qualquer forma, é apenas mais um
$group para reunir tudo e, em seguida, os estágios opcionais, se você realmente precisa ter esse formato de dados. Mas eu pessoalmente lidaria com qualquer acesso do "par" no código que precisa lidar com isso. 
