Um grande risco da abordagem SQLite é que, à medida que seus requisitos de escala aumentam, você não poderá (facilmente) implantar em vários servidores de aplicativos. Você pode particionar seus usuários em servidores separados, mas se esse servidor ficar inativo, você terá um subconjunto de usuários que não poderá acessar seus dados.

O uso do MongoDB (ou qualquer outro serviço centralizado) alivia esse problema, pois seus servidores da Web não têm estado - eles podem ser adicionados ou removidos a qualquer momento para acomodar a carga da Web sem ter que se preocupar com quais dados residem e onde.