Facet + Consulta Agregada usando o problema ObjectId com Spring Data Mongo

Você está mapeando o campo id incorretamente no estágio do projeto e do grupo.

Deve ser _id não identificação. Altere também o tipo de email para String. Funciona para mim.

GroupOperation groupOp = Aggregation
            .group("firstName", "lastName", "email", "status", "_id")
            .addToSet("department").as("department").addToSet("address").as("address");

ProjectionOperation projectStage = Aggregation.project("firstName", "lastName", "email", "status", "department", "address", "_id");

...

AggregationResults<EmployeeOutFacet> EmployeeOutList = mongoTemplate.aggregate(aggregation, mongoTemplate.getCollectionName(Employee.class), EmployeeOutFacet.class);