A documentação do Djongo não está correta ou desatualizada. Consegui fazer com que meu aplicativo Django se conectasse a um mongodb usando as seguintes configurações:
DATABASES = {
'default': {
'ENGINE': 'djongo',
'CLIENT': {
'host': 'mongodb+srv://<URL>',
'username': 'something',
'password': 'somepass',
'authMechanism': 'SCRAM-SHA-1'
}
}
}