Você pode escrever um wrapper, um novo módulo onde você armazena a instância de banco de dados, algo semelhante a isto:
//db.js
var HOSTNAME = ...
var PORT = ...
var db = module.exports = {};
var instance;
db.connect = function (){
...
instance = <db_instance>;
};
db.disconnect = function (){
...
instance = null;
};
db.instance = function (){
return instance;
};
Agora, toda vez que você precisar da instância de banco de dados, recupere-a fazendo:
var db = require ("./path/to/db");
db.instance ();