Claro que é possível, mas você precisará encontrar uma maneira de forçar a flexibilidade de um banco de dados de documentos como o MongoDB em um RDBMS como o SQL Server.

Isso significa que você precisa definir como deseja lidar com campos ausentes (será um NULL na coluna db? ou um valor padrão?) e outras coisas que geralmente não se encaixam bem em um banco de dados relacional.

Dito isso, você pode usar uma ferramenta ETL capaz de se conectar a ambos os bancos de dados, o SSIS pode ser um exemplo se você quiser permanecer no mundo MicroSoft (você pode verificar isso Importando dados do MongoDB usando o SSIS 2012 para ter uma ideia) ou você pode optar por uma ferramenta de código aberto como Talend Big Data Integration que tem um conector para o MongoDB (e, claro, para o SQL Server).