O MongoDB armazenou procedimentos Javascript, mas nenhum agendador.

http://docs.mongodb.org/manual/ tutorial/store-javascript-function-on-server/

Você pode acionar isso de uma máquina cliente usando um cron job e o shell mongo. No entanto, eu recomendo simplesmente executar um script em Python ou linguagem de script do lado do cliente semelhante. Será muito mais fácil controlar a versão e depurar do que o Javascript do lado do servidor.