O que você vai querer fazer é algo assim:
{'$set': {'me.webpage': 'stackoverflow'} }
Observe que a única diferença é que estou usando a notação de ponto para apontar para um subdocumento.
Pense nisso como se fosse um objeto JSON normal fora do Mongo. Você usa a notação de ponto para acessar as propriedades dos objetos - o mongo funciona da mesma maneira.
Aqui está um link para a documentação relevante sobre subdocumentos e a notação de ponto no mongo - http://docs.mongodb.org/manual/core/document/#dot-notation
