Eu tenho o mesmo problema para agregação de tempo de logs. Acho que tenho a solução para você.
Descobri que a opção
socketTimeoutMS é responsável por isso. Verifique o padrão do seu mongo_client.js socketTimeoutMS valor. Para mim foi 2min . Módulo Mongodb versão 2.1.18. Então, basta adicionar esta opção em sua url:
mongodb://localhost:27017/test?maxPoolSize=2&socketTimeoutMS=60000
Ele definirá
timeout a 10 min. Isso faz o truque para mim. 
