O
from campo em $lookup é o nome da coleção, não um nome de variável de modelo. Então, se você está inicializando o modelo assim db.model('User', userSchema)
então a consulta de pesquisa deve ser
commentModel.aggregate([{$lookup: {
from: 'users',
localField: 'author',
foreignField: '_id',
as: 'common'
}])
