Existe um método que não requer que você use nenhum outro software além dos utilitários mysql e mongodb. A desvantagem é que você tem que ir tabela por tabela, mas no seu caso você só precisa migrar uma tabela, então não será doloroso.
Eu segui este tutorial. As partes relevantes são:
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Obtenha um CSV com seus dados. Você pode gerar um com a seguinte consulta no mysql.
SELECT [fields] INTO outfile 'user.csv' FIELDS TERMINATED BY ',' LINES TERMINATED BY '\n' FROM [table]
- Por fim, importe o arquivo usando
mongoimport
.Isso é tudo