A chamada para
mongoose.model estabelece o nome da coleção à qual o modelo está vinculado, sendo o padrão o nome do modelo pluralizado e em minúsculas. Então, com seu código, isso seria 'models' . Para usar o modelo com os files coleção, altere essa linha para:var Model = mongoose.model("Model", fileSchema, "files");
ou
var Model = mongoose.model("file", fileSchema);
