Classificar matriz aninhada de objetos

Eu guardaria na ordem que você quer de volta. Ou classifique-o depois de retirá-lo, no lado do cliente.

Se nenhuma dessas opções for possível, você pode usar a estrutura de agregação:

> db.test.insert({answers: [
...                 {name: 'paul', state: 'RU'},
...                 {name: 'steve', state: 'US'}, 
...                 {name: 'mike', state: 'DE'}]});
> db.test.insert({answers: [
...                 {name: 'paul', state: 'RU'},
...                 {name: 'steve', state: 'US'}, 
...                 {name: 'xavier', state: 'TX'}]});

db.test.aggregate([
  {$unwind: "$answers"}, 
  {$sort: {"answers.name":1}}, 
  {$group: {_id:"$_id", answers: {$push:"$answers"}}}
]);

produz:

{
  "result" : [
  {
    "_id" : ObjectId("5053b2477d820880c3469364"),
    "answers" : [
      {
        "name" : "paul",
        "state" : "RU"
      },
      {
        "name" : "steve",
        "state" : "US"
      },
      {
        "name" : "xavier",
        "state" : "TX"
      }
    ]
  },
  {
    "_id" : ObjectId("5053af9f7d820880c3469363"),
    "answers" : [
      {
        "name" : "mike",
        "state" : "DE"
      },
      {
        "name" : "paul",
        "state" : "RU"
      },
      {
        "name" : "steve",
        "state" : "US"
      }
    ]
  }
],
  "ok" : 1
}