A única maneira de conseguir isso atualmente é anotando sua classe de domínio com @Document usando a collection A propriedade para definir o nome das instâncias de coleção desta classe deve ser mantida.

No entanto, há um problema do JIRA em aberto que sugere a adição de uma estratégia de nomenclatura conectável para configurar as formas como os nomes de classes, coleções e propriedades são tratados de maneira mais global. Sinta-se à vontade para comentar seu caso de uso e votar nele.