Você precisa usar o operador posicional $
Por exemplo:
update({
_id: 7,
"comments._id": ObjectId("4da4e7d1590295d4eb81c0c7")
},{
$set: {"comments.$.type": abc}
}, false, true
);
Eu não testei, mas espero que seja útil para você.
Se você deseja alterar a estrutura do documento, você precisa usar
db.collection.update(critérios,objNew, upsert, multi)
Argumentos:
criteria - query which selects the record to update; objNew - updated object or $ operators (e.g., $inc) which manipulate the object upsert - if this should be an "upsert"; that is, if the record does not exist, nsert it multi - if all documents matching criteria should be updated
e insira novo objNew com nova estrutura. verifique isso para mais detalhes