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Como usar a instrução case na condição where?


O predicado de um CASE expressão (ou seja, o que vem depois de THEN ) tem que ser um valor, em vez de lógica. Você pode reformular seu WHERE cláusula da seguinte forma:
WHERE
    p.resource_qry_seq = b.resource_qry_seq AND
    p.resource_id = b.resource_id AND
    ((b.flexible_time IS NULL AND
        (b.activity_start >= p.activity_start AND b.activity_end < p.activity_end) OR
        (b.activity_start > p.activity_start  AND b.activity_end <= p.activity_end)) OR
    (b.flexible_time IS NOT NULL AND b.activity_start > p.late_start))